绫波丽眼里涌现出不一样的神采，她忍不住对真嗣说：“碇君，我也好想和你一样。去亲身体验一番……”
真嗣抬起手，对绫波丽说：“那就一起吧，有你的陪伴，我或许不再孤独……”
他想起那夏天年幼的自己，也想起妈妈那时候对自己最后说了什么话。
碇唯：“真嗣，你不能忘了哟，来答应妈妈从今以后不管发生什么事情，你可要守护着全世界人们的幸福哦。”
阳光下，碇唯和真嗣小拇指拉勾许下承诺。
绫波丽问：“你确定想回到原来的世界？只不过那个世界已经成为一片废墟……
别人的手，声音会再度伤害你。”
真嗣眼神充满坚韧：“我不怕，我也知道，或许其实你说的没错，别人会用着他们的手来伤害我，而我的手也同样的会伤害到他人，曾经牵起的手能够相拥到最后，谁也不敢说。可是……
绫波，尽管如此。我还想要再一次的牵起你的手……”
许下愿望！
太空中
莉莉丝的脖颈处划出一道血口，鲜血喷洒而出！
背后的翅膀也随之散落，初号机从莉莉丝的眼珠里破壳而出。
特号机从莉莉丝的额头突破，巨大的额头中间出现一条断层裂缝。
初号机和特号机一起握住朗基努斯之枪，一人握住一边。
两台机体背部各自展开巨大的飞翼，朗基努斯之枪变化为双头叉。
eva量产机的伪朗基努斯之枪随之爆炸，他们的头颅也被爆炸余波摧毁，只留下坚固的机身从太空坠落。
绫波丽再一次真诚的微笑，她对真嗣说：“你还会等待我吗？碇君？”
真嗣看着绫波丽的眼睛，认真的说：“其实，我是真心喜欢你的。喜欢的感觉我无法说出来，不过下一次我们见面，它会详细的告诉你。绫波……”
绫波丽握住真嗣的手，眼眶积攒泪水：“谢谢你，碇君。那么我们就此道别了……
碇君，我很幸福。能够和你相遇，本来我一无所有，只是一个空壳子。可如今有你教给我的种种事物填满了我，我很高兴，只不过我们要分别了，这种场合该有的表情就是我现在的表情，对吗？”
绫波丽面带微笑，眼睛流下泪水，眼神里透露出不舍和遗憾，还有爱恋。
话音刚落，绫波丽化作一团光飞散开来……
真嗣着急地想伸手挽留，可以为时已晚……
莉莉丝的躯体在太空爆炸开来，额头分为左右一半沉在血红色的大海里。
碇君，我将粉碎，碎散，降临而灌注在万物之中，然后静静的等待着你的归来……
雪花落在地球上，大雪皑皑覆盖房屋，高楼，树木，车子……
真嗣从海水里浮起来，他看到对岸的爸爸妈妈。
碇唯一脸欣慰看着自己的儿子，对他说：“真嗣，谢谢你想起对我的承诺。你可以放心，有人会把所有的生命都有迈向复原的力量。万物自有求生的力量，梦境潜藏在现实中，而现实投影在梦里。最后……
真实会来到心里一个人的行程，是有他的心所造成。当人们能够用自己力量去想象自我，那么人人都能恢复人的形貌。
我会看着你，而我从今以后，永永远远在你存在世上的每一天，即使你死了，又诞生到世间来，我都会静静的，远远的看着你。
活下去，活下去，让自己的脚站起来往前走，不要怕，只要有太阳，月亮和地球，你就可以的……”
真嗣看着慢慢消失的父母，内心不再孤独和难过煎熬：“再会了，爸爸妈妈……”
“真嗣，该和我重启这个世界了。”
一道熟悉的声音从真嗣身后传来，真嗣回头一看正是黄哲田！
真嗣兴奋的对黄哲田问道：“哲田君！你怎么也来了？！”
黄哲田拍了拍真嗣的肩膀说：“毕竟你母亲委托我的事，我还没有完成。后面的就交给我了，还有，绫波丽终将会和你再次相遇！”
真嗣抬起头看向天空，眼神忧伤道：“可是不知道什么时候能和绫波见面。”
黄哲田从深海中抱起沉睡的明日香放在沙滩，对一旁的真嗣说：“我要封印明日香的记忆，重启后的世界里，她的记忆中不再有我，毕竟一个重新的世界怎么能被以前的记忆给困扰？
她接下来的新生活将是一个完整的，正常的。”
真嗣好奇的问：“那么绫波丽的记忆，还有其他人比如加持先生和美里阿姨呢？”
黄哲田哈哈一笑，解释道：“绫波丽的记忆会保存好。加持他们啊，有的是缘分，总有一天会撞在一起，只不过没有记忆罢了。如果有以前的记忆，也是有一段苦的烦恼，还不如重新从刚开始互相认识。”
黄哲田的战斗服已经破烂不堪，他拿起明日香已经黯淡无光的项链，重新修复后滴有明日香血液联系上，拿着项链对沉睡的明日香说：“明日香，我会给你一个全新的世界，它会如你所愿的